SALMONICS

2020-2022 SALMONICS (Projet Pulsar co-financé par la région Pays de la Loire)

Objectifs

La métagénomique est une technique de séquençage haut-débit qui permet de décrire l’ensemble des gènes présents au sein de l’écosystème (le microbiome). L’analyse des métagénomes permet d’apporter des réponses, non seulement sur l’identification des espèces présentes, mais aussi sur la fonctionnalité du microbiote et son rôle dans l’altération.

Dans cette perspective, les objectifs de ce projet visent à :

• Évaluer la potentialité de la métagénomique pour l’analyse du microbiome des produits de la mer et sa fonctionnalité.
• Décrypter les capacités métaboliques du microbiome d’altération, en les corrélant à d’autres données analytiques (biochimie, microbiologie, analyses sensorielles etc.).
• Mettre en évidence des voies métaboliques et des gènes biomarqueurs de l’altération.

Le modèle d’étude retenu est le saumon fumé. Le traitement et l’exploitation de ces données se fera en lien avec SeBiMER.